Amikor egy Version Cue-projektben lévő fájlokon dolgozik, és a Version Cue-kiszolgáló nem érhető el, a saját számítógépén lévő helyi projektfájlokat akkor is módosíthatja. Amikor a Version Cue-kiszolgáló ismét elérhetővé válik, szinkronizálhatja a helyi fájlokat a Version Cue-kiszolgálóval, hogy a fájlok új verzióját mentse a Version Cue-kiszolgálóra. Szinkronizálhat teljes projektet, illetve egy projekt egyetlen mappáját vagy fájlját is.

A kapcsolat nélküli fájlok használatához célszerű először a teljes Version Cue-projektet szinkronizálni, amikor a kiszolgáló még elérhető, biztosítva a helyi projektfájlok meglétét. A kapcsolat nélküli fájlokat szerkesztheti, majd amikor a kiszolgáló ismét elérhetővé válik, szinkronizálhatja azokat.