ניתן להתאים אישית תצורת גיבוי לפרוייקטים בהעדפות הפרוייקט של Version Cue. ניתן לגבות פרוייקט בתצורה חדשה או להשתמש בתצורה קיימת. תצורת גיבוי כוללת יכולת לתזמן גיבוי חוזר לפרוייקט.
כברירת מחדל, גיבויי פרוייקט מאוחסנים בתיקייהgram Files/Common Files/Adobe/Adobe Version Cue CS3/Server/Backups (Windows) או Library/Application Support/Adobe/Adobe Version Cue CS3/Server/Backups (Mac OS).
כדי לשמור רשימת משתמשים שהוקצו לפרוייקט, בחרו 'שחזר משתמשים'.
כדי לשמור את אותן הרשאות הגישה לכל משתמש שהוקצה, בחרו 'שחזר הקצאות משתמשים'.
להוספת הערות, הקלידו אותן בתיבה 'הערות'.
כשיוצרים תצורה חדשה, היא הופכת לאפשרות ברירת המחדל של הפרוייקט.