בשעת עבודה עם קבצים מפרוייקט של Version Cue, אתם עורכים עותק מקומי של הקובץ בתיקיית הפרוייקט בדיסק הקשיח, ולא את קובץ האב בשרת Version Cue, הנשאר מוגן וללא שינוי. קובצי פרוייקט מקומיים גם מאפשרים עבודה על קובץ בו-זמנית עם משתמשים אחרים.
במהלך העבודה, השתמשו מעת לעת בפקודה 'שמור' כדי לשמור שינויים ולעדכן את קובצי הפרוייקט המקומיים. גרסה חדשה נוספת לקובץ האב בשרת Version Cue כשבוחרים בפקודה 'הכנסה לאחסון' או 'שמור גרסה' (Acrobat), או כשמסנכרנים את הקבצים עם שרת Version Cue.