Jos käsittelet projektia, jolla on sama nimi kahdessa eri Version Cue -palvelimessa, Version Cue saattaa luoda useita kopioita, jotka näyttävät projektin paikalliselta projektitiedostokansiolta, mutta ovat todellisuudessa kahteen eri palvelimeen tallennettujen projektien paikallisia projektitiedostokansioita. Version Cue antaa näille kansioille nimeksi projektin nimen ja numeroon (esimerkiksi projekti_001 ja projekti_002). Voit poistaa nämä kansiot, kun olet tallentanut paikallisten projektitiedostojen versiot Version Cue -palvelimeen. (Voit myös jättää moninkertaiset paikalliset projektitiedostokansiot huomiotta.)

Jos haluat poistaa paikalliset projektitiedostokansiot, katkaise yhteys kuhunkin projektiin Adobe Bridgellä (katso kohtaa Projektiyhteyden katkaiseminen).