Kun Version Cue -palvelin käynnistetään ensimmäisen kerran, Version Cue luo automaattisesti oletuskirjautumisnimen (system), jolla on järjestelmänvalvojan oikeudet, ja pyytää määrittämään salasanan. Tällä kirjautumisnimellä ja salasanalla kirjaudutaan Version Cue Server Administrationiin.
Muutkin käyttäjät, joilla on järjestelmänvalvojan oikeudet, voivat kirjautua Version Cue Server Administrationiin.
(Windows) Napsauta tehtäväpalkissa olevaa Version Cue -kuvaketta hiiren kakkospainikkeella ja valitse Palvelimen hallinta.
(Mac OS) Osoita näytön yläosassa olevaa Version Cue -symbolia ja osoita sitten Server Administration.
Version Cue Server Administrationiin voidaan kirjautua myös Acrobatista, Flashista, InCopysta, InDesignista, Illustratorista ja Photoshopista.