إذا وصلت إلى مشروع له نفس الاسم على خادمي Version Cue مختلفين، فإن Version Cue قد يقوم بإنشاء نسخ من ما يبدو في مجلد ملفات المشروع المحلي، لكنها فعلياً هي مجلدات ملفات لمشروعين مختلفين يتم الوصول إليهما من الخوادم المختلفة. يسمي Version Cue تلك المجلدات باسم المشروع وبرقم (مثلاً، مشروع_001، مشروع_002). يمكنك حذف تلك المجلدات بعد أن تحفظ إصدارات من ملفات مشروعك المحلية على خادم Version Cue. (أو، يمكنك ببساطة تجاهل المجلدات المتعدد للملفات المشروع المحلي.)
لحذف مجلدات ملفات المشروع المحلية، استخدم Adobe Bridge للانفصال من المشروع (راجع انفصال من مشاريع).